В череде новых назначений, последовавших в правительстве и кремлевской администрации с приходом президента Дмитрия Медведева, одно привлекает особое внимание. Михаил Зурабов стал советником главы государства. Зурабов получил широкую известность в качестве главы Минздравсоцразвития, отмечает «Взгляд». За этой осторожной формулировкой прячется максимальная непопулярность Зурабова. Он слишком долго занимал «расстрельную» министерскую должность – аналогичную той, что в СССР была у министра сельского хозяйства.

В конце 2006 года депутаты от фракции «Единая Россия» направили российскому руководству обращение с просьбой отстранить от должности министра здравоохранения и социального развития Михаила Зурабова на время проведения расследований по фактам злоупотреблений в Фонде обязательного медицинского страхования и Пенсионном фонде РФ. Депутат от фракции «Единая Россия» Александр Хинштейн тогда заявлял, что череда обвинений и коррупционных скандалов в ведомстве Зурабова вызывает озабоченность в обществе. Документ подписали 30 депутатов-«единороссов», в том числе Иосиф Кобзон (глава комитета по культуре), Николай Ковалев (экс-глава ФСБ РФ, глава комитета по делам ветеранов), Михаил Гришанков (глава комиссии Госдумы по противодействию коррупции). Тогда же первый вице-спикер Госдумы Олег Морозов заявил, что по инициативе 30 депутатов-единороссов никакого официального решения на президиуме фракции и во фракции не принималось. Фракция не считает необходимым принимать политическое решение по каждой инициативе, это не в наших традициях, подчеркнул он.

В 1998-1999 годах Зурабов был советником президента Бориса Ельцина по социальным вопросам. В мае 1998 года Зурабов занял пост первого заместителя министра здравоохранения в правительстве Сергея Кириенко. В мае 2000 года был назначен председателем Пенсионного фонда. В марте 2004 года Зурабов был назначен министром здравоохранения и социального развития РФ в правительстве Михаила Фрадкова. В сентябре 2007 года Зурабов не вошел в «переходное» правительство Виктора Зубкова, и пресса решила, что его политическая карьера окончена.